Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ephb3P54754 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb3P54754 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ephb3P54754 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb3P54754 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb3P54754 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms