Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Faf1P54731 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Faf1P54731 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Faf1P54731 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Faf1P54731 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Faf1P54731 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Faf1P54731 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Faf1P54731 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Faf1P54731 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Faf1P54731 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Faf1P54731 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Faf1P54731 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faf1P54731 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms