Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Msh6P54276 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Msh6P54276 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
Msh6P54276 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Msh6P54276 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Msh6P54276 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Msh6P54276 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Msh6P54276 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Msh6P54276 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Msh6P54276 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Msh6P54276 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Msh6P54276 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Msh6P54276 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Msh6P54276 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Msh6P54276 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Msh6P54276 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Msh6P54276 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Msh6P54276 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Msh6P54276 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Msh6P54276 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Msh6P54276 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Msh6P54276 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Msh6P54276 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Msh6P54276 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Msh6P54276 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,8 ms