Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lbx1P52955 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lbx1P52955 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx1P52955 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lbx1P52955 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lbx1P52955 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lbx1P52955 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.4 ms