Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efnb1P52795 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efnb1P52795 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efnb1P52795 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms