Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3P52483 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ube2e3P52483 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube2e3P52483 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2e3P52483 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2e3P52483 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms