Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e1P52482 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e1P52482 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms