Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa9P50707 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa9P50707 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa9P50707 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16,53■□□□□ 0,24
Defa9P50707 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,5■□□□□ 0,23
Defa9P50707 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,4 ms