Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VegfbP49766 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VegfbP49766 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VegfbP49766 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VegfbP49766 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VegfbP49766 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VegfbP49766 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VegfbP49766 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VegfbP49766 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VegfbP49766 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VegfbP49766 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VegfbP49766 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VegfbP49766 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VegfbP49766 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VegfbP49766 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VegfbP49766 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VegfbP49766 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms