Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma2P49722 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma2P49722 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma2P49722 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma2P49722 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma2P49722 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psma2P49722 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma2P49722 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psma2P49722 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psma2P49722 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psma2P49722 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma2P49722 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psma2P49722 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma2P49722 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma2P49722 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psma2P49722 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms