Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpreP49446 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpreP49446 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtpreP49446 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpreP49446 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtpreP49446 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtpreP49446 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtpreP49446 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpreP49446 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtpreP49446 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtpreP49446 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtpreP49446 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpreP49446 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpreP49446 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtpreP49446 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpreP49446 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtpreP49446 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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