Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rfx1P48377 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rfx1P48377 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rfx1P48377 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rfx1P48377 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rfx1P48377 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms