Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CskP41241 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CskP41241 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CskP41241 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CskP41241 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CskP41241 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CskP41241 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CskP41241 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CskP41241 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CskP41241 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CskP41241 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CskP41241 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CskP41241 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CskP41241 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CskP41241 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CskP41241 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CskP41241 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CskP41241 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CskP41241 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CskP41241 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CskP41241 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CskP41241 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CskP41241 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CskP41241 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CskP41241 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CskP41241 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CskP41241 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CskP41241 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CskP41241 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CskP41241 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CskP41241 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CskP41241 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CskP41241 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CskP41241 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CskP41241 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CskP41241 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CskP41241 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CskP41241 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CskP41241 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CskP41241 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CskP41241 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CskP41241 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CskP41241 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CskP41241 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CskP41241 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CskP41241 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CskP41241 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CskP41241 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CskP41241 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CskP41241 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CskP41241 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CskP41241 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CskP41241 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CskP41241 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CskP41241 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CskP41241 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CskP41241 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CskP41241 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CskP41241 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CskP41241 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CskP41241 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CskP41241 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CskP41241 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CskP41241 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CskP41241 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CskP41241 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CskP41241 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CskP41241 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CskP41241 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CskP41241 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CskP41241 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CskP41241 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CskP41241 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CskP41241 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CskP41241 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CskP41241 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CskP41241 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CskP41241 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CskP41241 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CskP41241 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CskP41241 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CskP41241 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CskP41241 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CskP41241 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CskP41241 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CskP41241 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CskP41241 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CskP41241 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CskP41241 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CskP41241 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CskP41241 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CskP41241 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CskP41241 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CskP41241 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CskP41241 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CskP41241 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CskP41241 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CskP41241 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CskP41241 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CskP41241 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms