Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd9P40240 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd9P40240 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd9P40240 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd9P40240 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd9P40240 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd9P40240 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd9P40240 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd9P40240 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd9P40240 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd9P40240 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd9P40240 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd9P40240 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd9P40240 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd9P40240 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd9P40240 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd9P40240 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms