Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TtlP38585 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TtlP38585 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TtlP38585 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtlP38585 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtlP38585 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TtlP38585 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtlP38585 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtlP38585 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TtlP38585 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TtlP38585 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TtlP38585 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtlP38585 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TtlP38585 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TtlP38585 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TtlP38585 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TtlP38585 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TtlP38585 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TtlP38585 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TtlP38585 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtlP38585 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtlP38585 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtlP38585 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtlP38585 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtlP38585 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtlP38585 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TtlP38585 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TtlP38585 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TtlP38585 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TtlP38585 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TtlP38585 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtlP38585 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtlP38585 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtlP38585 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtlP38585 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtlP38585 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtlP38585 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtlP38585 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtlP38585 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtlP38585 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtlP38585 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtlP38585 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TtlP38585 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TtlP38585 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TtlP38585 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TtlP38585 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TtlP38585 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TtlP38585 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TtlP38585 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TtlP38585 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TtlP38585 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TtlP38585 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TtlP38585 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TtlP38585 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TtlP38585 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TtlP38585 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TtlP38585 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TtlP38585 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TtlP38585 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TtlP38585 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtlP38585 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtlP38585 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtlP38585 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtlP38585 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtlP38585 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TtlP38585 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TtlP38585 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TtlP38585 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TtlP38585 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TtlP38585 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TtlP38585 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TtlP38585 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TtlP38585 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TtlP38585 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TtlP38585 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TtlP38585 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TtlP38585 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TtlP38585 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TtlP38585 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtlP38585 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TtlP38585 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtlP38585 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtlP38585 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms