Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Flt1P35969 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Flt1P35969 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Flt1P35969 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Flt1P35969 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Flt1P35969 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Flt1P35969 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Flt1P35969 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Flt1P35969 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Flt1P35969 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Flt1P35969 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt1P35969 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Flt1P35969 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Flt1P35969 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Flt1P35969 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Flt1P35969 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Flt1P35969 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Flt1P35969 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms