Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Grin2aP35436 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Grin2aP35436 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Grin2aP35436 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2aP35436 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Grin2aP35436 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
Grin2aP35436 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Grin2aP35436 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Grin2aP35436 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms