Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfap2aP34056 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tfap2aP34056 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tfap2aP34056 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tfap2aP34056 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms