Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm4P32211 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrm4P32211 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrm4P32211 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrm4P32211 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms