Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Notch4P31695 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Notch4P31695 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Notch4P31695 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Notch4P31695 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Notch4P31695 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Notch4P31695 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Notch4P31695 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Notch4P31695 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Notch4P31695 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Notch4P31695 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Notch4P31695 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Notch4P31695 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Notch4P31695 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155 ms