Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc10P31257 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxc10P31257 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxc10P31257 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc10P31257 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc10P31257 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms