Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RxrgP28705 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrgP28705 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxrgP28705 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxrgP28705 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrgP28705 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrgP28705 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RxrgP28705 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrgP28705 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxrgP28705 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrgP28705 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RxrgP28705 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxrgP28705 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxrgP28705 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RxrgP28705 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms