Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RxrbP28704 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxrbP28704 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RxrbP28704 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RxrbP28704 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RxrbP28704 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrbP28704 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrbP28704 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RxrbP28704 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrbP28704 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxrbP28704 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RxrbP28704 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RxrbP28704 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RxrbP28704 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RxrbP28704 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RxrbP28704 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RxrbP28704 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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