Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxraP28700 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxraP28700 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxraP28700 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxraP28700 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxraP28700 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RxraP28700 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxraP28700 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxraP28700 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxraP28700 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxraP28700 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxraP28700 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxraP28700 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxraP28700 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxraP28700 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxraP28700 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxraP28700 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxraP28700 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxraP28700 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxraP28700 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxraP28700 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxraP28700 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RxraP28700 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxraP28700 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxraP28700 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RxraP28700 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxraP28700 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxraP28700 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxraP28700 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxraP28700 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxraP28700 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxraP28700 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RxraP28700 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxraP28700 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxraP28700 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxraP28700 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RxraP28700 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RxraP28700 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RxraP28700 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RxraP28700 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RxraP28700 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RxraP28700 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxraP28700 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxraP28700 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxraP28700 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RxraP28700 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RxraP28700 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxraP28700 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxraP28700 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxraP28700 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxraP28700 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxraP28700 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxraP28700 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RxraP28700 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxraP28700 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RxraP28700 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxraP28700 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxraP28700 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxraP28700 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxraP28700 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RxraP28700 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RxraP28700 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxraP28700 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxraP28700 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxraP28700 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxraP28700 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxraP28700 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxraP28700 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RxraP28700 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RxraP28700 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxraP28700 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxraP28700 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RxraP28700 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxraP28700 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxraP28700 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RxraP28700 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxraP28700 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxraP28700 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxraP28700 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RxraP28700 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RxraP28700 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RxraP28700 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RxraP28700 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RxraP28700 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RxraP28700 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxraP28700 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxraP28700 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxraP28700 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxraP28700 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RxraP28700 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RxraP28700 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RxraP28700 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RxraP28700 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RxraP28700 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxraP28700 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxraP28700 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxraP28700 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RxraP28700 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxraP28700 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RxraP28700 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms