Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd9P28357 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd9P28357 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd9P28357 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd9P28357 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd9P28357 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd9P28357 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd9P28357 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd9P28357 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd9P28357 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms