Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsgP28293 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsgP28293 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsgP28293 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CtsgP28293 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsgP28293 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsgP28293 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtsgP28293 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsgP28293 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsgP28293 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsgP28293 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsgP28293 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsgP28293 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CtsgP28293 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 504.1 ms