Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-DMaP28078 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-DMaP28078 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-DMaP28078 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms