Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav1P27870 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav1P27870 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav1P27870 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vav1P27870 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav1P27870 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vav1P27870 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav1P27870 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav1P27870 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav1P27870 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vav1P27870 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vav1P27870 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vav1P27870 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms