Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CenpbP27790 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CenpbP27790 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CenpbP27790 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CenpbP27790 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CenpbP27790 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CenpbP27790 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CenpbP27790 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CenpbP27790 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CenpbP27790 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CenpbP27790 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CenpbP27790 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms