Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
CftrP26361 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CftrP26361 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CftrP26361 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CftrP26361 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CftrP26361 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CftrP26361 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CftrP26361 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CftrP26361 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CftrP26361 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CftrP26361 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CftrP26361 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CftrP26361 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CftrP26361 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CftrP26361 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CftrP26361 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CftrP26361 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.03
CftrP26361 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
CftrP26361 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CftrP26361 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CftrP26361 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CftrP26361 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CftrP26361 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CftrP26361 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CftrP26361 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CftrP26361 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CftrP26361 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CftrP26361 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CftrP26361 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CftrP26361 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CftrP26361 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CftrP26361 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CftrP26361 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CftrP26361 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
CftrP26361 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
CftrP26361 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CftrP26361 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4
CftrP26361 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CftrP26361 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CftrP26361 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CftrP26361 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CftrP26361 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CftrP26361 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CftrP26361 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CftrP26361 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CftrP26361 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CftrP26361 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CftrP26361 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CftrP26361 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CftrP26361 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CftrP26361 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CftrP26361 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CftrP26361 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CftrP26361 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CftrP26361 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CftrP26361 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CftrP26361 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
CftrP26361 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CftrP26361 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CftrP26361 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CftrP26361 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CftrP26361 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CftrP26361 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CftrP26361 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CftrP26361 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CftrP26361 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CftrP26361 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CftrP26361 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CftrP26361 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CftrP26361 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
CftrP26361 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CftrP26361 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CftrP26361 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CftrP26361 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
CftrP26361 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CftrP26361 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CftrP26361 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CftrP26361 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CftrP26361 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CftrP26361 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CftrP26361 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CftrP26361 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CftrP26361 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CftrP26361 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
CftrP26361 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CftrP26361 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CftrP26361 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CftrP26361 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CftrP26361 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CftrP26361 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CftrP26361 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CftrP26361 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CftrP26361 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CftrP26361 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CftrP26361 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CftrP26361 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CftrP26361 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
CftrP26361 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CftrP26361 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
CftrP26361 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms