Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nfkb1P25799 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nfkb1P25799 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfkb1P25799 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nfkb1P25799 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nfkb1P25799 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms