Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pou2f1P25425 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou2f1P25425 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f1P25425 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f1P25425 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms