Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aldh1a1P24549 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aldh1a1P24549 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Aldh1a1P24549 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aldh1a1P24549 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a1P24549 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms