Protein–RNA interactions for Protein: P23881

Tcea3, Transcription elongation factor A protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea3P23881 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea3P23881 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea3P23881 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea3P23881 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcea3P23881 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms