Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfyaP23708 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfyaP23708 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfyaP23708 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NfyaP23708 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfyaP23708 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfyaP23708 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfyaP23708 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfyaP23708 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfyaP23708 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NfyaP23708 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfyaP23708 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfyaP23708 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfyaP23708 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms