Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BdnfP21237 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BdnfP21237 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BdnfP21237 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BdnfP21237 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BdnfP21237 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BdnfP21237 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BdnfP21237 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BdnfP21237 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms