Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ntf3P20181 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ntf3P20181 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ntf3P20181 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms