Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VimP20152 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VimP20152 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VimP20152 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VimP20152 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VimP20152 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VimP20152 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VimP20152 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VimP20152 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VimP20152 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VimP20152 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VimP20152 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VimP20152 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VimP20152 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VimP20152 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VimP20152 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VimP20152 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VimP20152 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VimP20152 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VimP20152 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VimP20152 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VimP20152 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VimP20152 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VimP20152 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VimP20152 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VimP20152 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VimP20152 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VimP20152 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VimP20152 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VimP20152 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VimP20152 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VimP20152 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VimP20152 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VimP20152 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VimP20152 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VimP20152 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VimP20152 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VimP20152 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VimP20152 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VimP20152 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VimP20152 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VimP20152 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VimP20152 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VimP20152 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VimP20152 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VimP20152 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VimP20152 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VimP20152 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VimP20152 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VimP20152 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VimP20152 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VimP20152 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VimP20152 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VimP20152 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VimP20152 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VimP20152 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VimP20152 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VimP20152 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VimP20152 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VimP20152 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VimP20152 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VimP20152 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VimP20152 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VimP20152 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VimP20152 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VimP20152 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VimP20152 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VimP20152 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VimP20152 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VimP20152 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VimP20152 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VimP20152 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VimP20152 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VimP20152 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VimP20152 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms