Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Esr1P19785 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Esr1P19785 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Esr1P19785 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Esr1P19785 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Esr1P19785 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Esr1P19785 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Esr1P19785 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Esr1P19785 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Esr1P19785 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Esr1P19785 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Esr1P19785 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Esr1P19785 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esr1P19785 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Esr1P19785 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms