Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rps6ka1P18653 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rps6ka1P18653 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6ka1P18653 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms