Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18530 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P18530 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P18530 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P18530 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P18530 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P18530 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P18530 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P18530 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P18530 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18530 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P18530 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P18530 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P18530 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P18530 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P18530 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P18530 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18530 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18530 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18530 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18530 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18530 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18530 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18530 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18530 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18530 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18530 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18530 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18530 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18530 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18530 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18530 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18530 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18530 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18530 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18530 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18530 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P18530 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P18530 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P18530 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P18530 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18530 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18530 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18530 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18530 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18530 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18530 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18530 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18530 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18530 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18530 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P18530 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P18530 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18530 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18530 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18530 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18530 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18530 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18530 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18530 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18530 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P18530 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P18530 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18530 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P18530 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18530 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18530 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18530 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18530 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18530 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18530 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18530 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P18530 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18530 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18530 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18530 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18530 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18530 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18530 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18530 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms