Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnaP17918 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PcnaP17918 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcnaP17918 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PcnaP17918 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PcnaP17918 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcnaP17918 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PcnaP17918 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnaP17918 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcnaP17918 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PcnaP17918 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms