Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defa-rs2P17534 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Defa-rs2P17534 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa-rs2P17534 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms