Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tgfb3P17125 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgfb3P17125 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tgfb3P17125 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgfb3P17125 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms