Protein–RNA interactions for Protein: P13595

Ncam1, Neural cell adhesion molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncam1P13595 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ncam1P13595 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncam1P13595 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ncam1P13595 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncam1P13595 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ncam1P13595 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms