Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Tnni2P13412 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Tnni2P13412 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Tnni2P13412 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,3 ms