Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calb1P12658 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calb1P12658 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calb1P12658 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calb1P12658 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb1P12658 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calb1P12658 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calb1P12658 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calb1P12658 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb1P12658 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calb1P12658 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calb1P12658 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Calb1P12658 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms