Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RaraP11416 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RaraP11416 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaraP11416 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaraP11416 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaraP11416 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaraP11416 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RaraP11416 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaraP11416 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaraP11416 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaraP11416 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaraP11416 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RaraP11416 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaraP11416 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaraP11416 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaraP11416 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaraP11416 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaraP11416 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaraP11416 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RaraP11416 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RaraP11416 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RaraP11416 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RaraP11416 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RaraP11416 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RaraP11416 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RaraP11416 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RaraP11416 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RaraP11416 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RaraP11416 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RaraP11416 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RaraP11416 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RaraP11416 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RaraP11416 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RaraP11416 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RaraP11416 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RaraP11416 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RaraP11416 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RaraP11416 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RaraP11416 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RaraP11416 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RaraP11416 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RaraP11416 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RaraP11416 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RaraP11416 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RaraP11416 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaraP11416 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaraP11416 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaraP11416 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RaraP11416 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RaraP11416 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RaraP11416 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RaraP11416 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RaraP11416 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RaraP11416 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RaraP11416 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RaraP11416 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RaraP11416 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaraP11416 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaraP11416 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RaraP11416 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaraP11416 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaraP11416 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaraP11416 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RaraP11416 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RaraP11416 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RaraP11416 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RaraP11416 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RaraP11416 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RaraP11416 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RaraP11416 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RaraP11416 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RaraP11416 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RaraP11416 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaraP11416 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RaraP11416 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RaraP11416 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RaraP11416 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RaraP11416 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RaraP11416 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RaraP11416 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaraP11416 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaraP11416 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaraP11416 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaraP11416 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RaraP11416 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RaraP11416 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RaraP11416 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RaraP11416 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RaraP11416 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RaraP11416 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RaraP11416 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms