Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fv4P11370 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fv4P11370 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv4P11370 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv4P11370 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fv4P11370 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fv4P11370 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fv4P11370 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv4P11370 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fv4P11370 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fv4P11370 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fv4P11370 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms