Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxb3P09026 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb3P09026 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxb3P09026 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb3P09026 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms